Para eliminar una cuenta en WHM totalmente hay que revisar los siguientes puntos.
Cuenta de usuario en cPanel
Es posible que haya quedado guardado el usuario en cPanel. Para eliminarlo, como siempre, accederemos a WHM >Account Functions > Terminate an account
Entradas para el usuario en /etc/passwd
Dentro del archivo /etc/passwd pueden quedar residuos del usuario. Para eliminarlo, sólo tendremos que editarlo y buscar la última línea, que será la correspondiente a nuestro nuevo usuario.
nano /etc/passwd
Directorio home del usuario
A veces, aunque la copia falle, el directorio home para el usuario queda creado, por lo que no es posible volver a intentar la copia.
Para eliminar su directorio home, ejecutaremos el siguiente comando:
rm -dfr /home/usuario
Zona DNS de los dominios
También es muy probable que hayan sido creadas las zonas DNS para los dominios. Por lo que tendremos que eliminarlas desde WHM > DNS Functions > Delete a DNS zone
Grupo del usuario
El grupo de archivos del usuario ha podido quedar guardado. Para eliminarlo:
groupdel usuario
Eliminar entradas del archivo httpd.conf
Por último, tendremos que editar el archivo httpd.conf y eliminar el virtualhost para el dominio:
nano /usr/local/apache/conf/httpd.conf